馬德里擁有許多公立和私立大學。其中一些是世界上最古老的，而當中也有許多是最富盛名的大學。

西班牙國立教育大學​(Universidad Nacional de Educación a Distancia )的主旨是通過遠程教育的形式提供高等教育的公共服務。

馬德里康普頓斯大學​(Universidad Complutense de Madrid)是西班牙第二大大學，僅次於UNED。

馬德里技術大學​(Universidad Politécnica de Madrid)是西班牙頂尖的技術大學，是由不同的工程技術學院所合併的。

馬德里自治大學​(Universidad Autónoma de Madrid)是在著名物理學家NicolásCabrera的領導下所成立的。此大學在理論物理方面的研究是廣受任可的。

馬德里查理三世大學​(Universidad Carlos III de Madrid)以培養負責任的自由思想學者為理念。以自由、正義和寬容的態度積極參與改善社會問題。

 

其餘著名大學包括阿爾卡拉大學（Universidad de Alcalá），1975年在Alcalá deHenares重建；胡安卡洛斯國王大學（Universidad Rey Juan Carlos），是馬德里第二大大學；和Comillas Pontifical University（Universidad Pontificia Comillas）。

 

馬德里也富有兩間音樂學院，蘇菲亞女王音樂學院 (Escuela Superior de MúsicaReina Sofía)和馬得理黃家音樂學院 (Real Conservatorio Superior de Música deMadrid)。

 

商學院則是IE商學院(Instituto de Empresa)，主校區位於馬德里的Chamartín和Salamanca地區的邊界。 IE商學院在華爾街日報獲選為2009年度最佳MBA課程排名中第一。